Университет основан в 1967 году как Новосибирский институт народного хозяйства (НИНХ). Статус университета получил в 2004 году.
Цель университета: формирование НГУЭУ как ведущего вуза в области регионального развития на основе концепции «предпринимательского университета».
В НГУЭУ реализованы все уровни образования: среднее профессиональное, высшее (бакалавриат, специалитет, магистратура, аспирантура) и более 100 программ дополнительного образования. Выпускники НГУЭУ — известные политики, предприниматели, бизнес-тренеры, ведущие топ-менеджеры крупных компаний.